أكّد مصدر أمني أن سجن برج العرب قد خصص زنزانة للسجين الرئيس المصري السابق محمد مرسي، ويشهد السجن الأن حالة من الاستنفار الأمني، تحسباً لنقله إليه، عقب انتهاء المحاكمة . وتتكون منطقة سجون برج العرب من ثلاثة أقسام، الأول منها كتيبة الأمن المركزي، المكلفة بحماية وتأمين السجن، وتقع على مساحة شاسعة من الأراضي، التي تحوي بعض المباني، منها عنابر مبيت المجندين والمسجد. أما القسم الثاني فهو سجن برج العرب الاحتياطي، والقسم الأخير هو ليمان برج العرب، وهو السجن المخصص لمن وقعت عليهم أحكام بالسجن المشدد. ويحيط بسجن برج العرب سورين مرتفعين، تعلوهما عدد من أبراج المراقبة، يحيط السور الأول بمنطقة سجون برج العرب، ويطوقها من الخارج، بينما يحيط الثاني بسجن برج العرب الاحتياطي وليمان برج العرب، الأمر الذي يصبح معه مجرد التفكير في الهرب من السجن، عبر تسلق الأسوار، مهمة مستحيلة، لصعوبة تسلق الأسوار، التي يقدر ارتفاعها بحوالي سبعة أمتار، وأيضًا لانتشار عناصر المراقبة المسلحين داخل الأبراج، والمكلفين بإطلاق الرصاص على أي سجين يحاول الهرب.